Shinobi no Ittoki تدور قصة عن إيتوكي ساكورابا حيث كان طالبًا عاديًا حتى انقلبت حياته رأسًا على عقب! اكتشف أنه الوريث التاسع عشر لعشيرة النينجا إيغا الشهيرة. يجب على إيغا محاولة الدفاع عن ملكهم من عشيرة كوغا وهي عشيرة متنافسة تسعى لإنهاء حياة إيتوكي. لم يتبق له أي خيار سوى أن يصبح شينوبي قوي ليس فقط لحماية نفسه ولكن أيضًا قريته.
